| Titre : | Typage moléculaire des mycobactéries responsables de la tuberculose bovine dans quelques abattoirs d’Alger |
| Auteurs : | Belakehal, Faiza, Auteur ; M. Naim, Directeur de thèse |
| Type de document : | texte imprimé |
| Editeur : | Alger : École Nationale Supérieure Vétérinaire, 2022 |
| Format : | 107 f. / ill. / 30 cm |
| Accompagnement : | CD- Rom |
| Note générale : |
Thèse de Doctorat: Sciences Vétérinaire: Alger, École Nationale Supérieure Vétérinaire: 2022
Bibliogr., f.108-130 ; Annexes, f. 131-144 |
| Langues : | Français |
| Mots-clés : | Tuberculose bovine ; Lésions et blessures ; Abattoirs ; Séroépidémiologie ; Facteurs de risque ; Mycobacterium bovis ; Bovins |
| Résumé : |
La tuberculose bovine (TB) causée par M. bovis et M. caprae est une maladie transmissible du bétail ayant des conséquences économiques considérables et notifiée à l'Organisation mondiale de la santé animale (OIE). Afin d'estimer la prévalence et les facteurs de risque associés à la TB et pour mieux comprendre les voies de propagation, une étude a été menée dans quelques abattoirs algériens durant la période 2013-2017, incluant l’inspection des carcasses bovines, la culture et l’examen microscopique d'échantillons de tissus ainsi qu’une analyse par caractérisation moléculaire des souches isolées. Sur les 3848 carcasses bovines examinées, 184 (4,78%) présentaient des lésions visibles suspectes de TB. 84,8% des lésions sont observées dans la cavité thoracique. Les lésions sont prédominantes dans les ganglions lymphatiques trachéobronchiques (71,7%), le tissu pulmonaire (4,9%), les ganglions lymphatiques rétropharyngés (4,9%), le tissu hépatique et les ganglions lymphatiques associés (7,6%). Elles sont moins fréquentes, dans les ganglions lymphatiques préscapulaires (1,6%), le tube digestif (0,5%) et les reins (0,5 %). Nos résultats ont révélé un taux d'infection plus élevé (p<0,0001) chez les mâles (78,8%) que chez les femelles (21,2%). Une différence significative (p<0,05) du taux d'infection est enregistrée entre les trois catégories d'âge : 2 à 6 ans (42,9%), <2 ans (39,1%) et ≥6 ans (17,9%). L'analyse des données enregistrées montre une variation saisonnière significative (p<0,0001) de la prévalence de la TB avec une fréquence plus élevée durant la saison sèche par rapport à la saison humide. L'examen microscopique de 105 échantillons a révélé que 60 (57,1%) hébergeaient des BAAR et 45 (42,9%) étaient négatifs (p˃0,05). La culture a révélé 60 (57,1%) échantillons positifs, 43 (41%) négatifs et seulement 2 (1,9%) échantillons contaminés. Selon, l'analyse par PCR-RD9, toutes les souches isolées appartenaient au CMT. Soixante souches ont été caractérisées par spoligotypage, dont 42 par 19 locus MIRU-VNTR. Le spoligotypage a révélé 16 profils distincts (HGDI=0,8294), les types SB0120 (n = 20) et SB0121 (n = 13) étant les profils les plus fréquents, représentant 55 % des souches analysées. Les analyses basées sur le typage 19 locus MIRU-VNTR ont révélé la présence de 32 profils différents, cinq clusters et un profil orphelin, indiquant un pouvoir discriminatoire plus élevé (HGDI = 0,9779) que le spoligotypage. Sept loci VNTR [VNTR 577 (alias ETR C), 2163b (QU11b), 2165 (ETR A), 2461 (ETR B), 3007 (MIRU 27), 2163a (QUB11a) et 3232 (QUB 3232)] sont les plus discriminants (HGDI ˃ 0,50). En conclusion, les 19 loci MIRU-VNTR ont révélé plus d'informations que le spoligotypage concernant la différenciation moléculaire des souches et facilite mieux l'élucidation des voies de transmission de M. bovis dans les troupeaux de bovins algériens. Les présents résultats peuvent servir d'informations de base pour élaborer un programme d'éradication adéquat de la TB en Algérie
Abstract : Bovine tuberculosis (BT) caused by M. bovis and M. caprae is a transmissible disease of livestock with high economic consequences and notifiable to the World Organization for Animal Health (OIE). To estimate the prevalence and risk factors associated to BT and elucidate the propagation route, a study was conducted in Algerian abattoirs during the period of 2013-2017, involving detailed inspection, microscopic examination, culture of tissue samples and molecular investigation. Out of 3848 bovine carcasses examined, 184 (4.78%) exhibit visible lesions suggestive of tuberculosis. Anatomically 84.8% of the lesions were found in thoracic cavity. Lesions were predominant in tracheobronchial lymph nodes (71.7%), lung tissue (4.9%) and retropharyngeal lymph nodes (4.9%), followed by hepatic tissue and associated lymph nodes (7.6%). Less frequently, lesions were observed in prescapular lymph nodes (1.6%), digestive tract (0.5%) and kidney (0.5%). The study revealed statistically high (p<0.0001) infection rate in males (78.8%) than females (21.2%). A Significant difference (p<0.05) in tuberculosis infection rate was recorded between the three age animal categories: 2 to 6 years (42.9%), <2 years (39.1%) and ≥6 years (17.9%). Analysis of data recorded in the present study showed a high significant variation (p<0.0001) in seasonal prevalence of BT with a higher frequency during dry season than in rainy season. Microscopic examination of 105 samples revealed that 60 (57.1%) harbored acid-fast-bacilli (AFB) and 45(42.9%) were negative (p˃0.05). Culture yielded 60 (57.1%) positive, 43(41%) negative and only 2(1.9%) samples were contaminated. In PCR RD9 analysis, all isolated strains were belonging to the Mycobacterium tuberculosis complex (MTC). In order to better understand the route of spreading, characterization of mycobacteria has been performed. Sixty strains have been analyzed by spoligotyping, thereof 42 by 19-locus-MIRU-VNTR-typing. Spoligotyping revealed 16 distinguishable patterns (HGDI=0.8294), with types SB0120 (n = 20) and SB0121 (n = 13) being the most frequent patterns, representing 55% of the strains. Analyses based on 19-locus-MIRU-VNTR yielded 32 different profiles, five clusters and one orphan pattern, showing higher discriminatory power (HGDI = 0.9779) than spoligotyping. Seven VNTR-loci [VNTR 577 (alias ETR C), 2163b (QU11b), 2165 (ETR A), 2461 (ETR B), 3007 (MIRU 27), 2163a (QUB11a) and 3232 (QUB 3232)] were the most discriminative loci (HGDI ˃ 0.50). In conclusion, 19-locus-MIRU-VNTR yielded more information than spoligotyping concerning molecular differentiation of strains and better supports the elucidation of transmission routes of M. bovis between Algerian cattle herds. The present findings can serve as background information to elaborate an adequate eradication program for BT in Algeria. |
Exemplaires (5)
| Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
|---|---|---|---|---|---|
| D4.05018.00/1 | D4.05018.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
| D4.05018.00/2 | D4.05018.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
| D4.05018.00/3 | D4.05018.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
| D4.05018.00/4 | D4.05018.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
| D4.05018.00/5 | D4.05018.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
