Titre : | Prévalence, étude de la sensibilité aux antibiotiques et typage des souches animales et humaines de Campylobacter thermotolérants isolées dans l'Est de l'Algérie |
Auteurs : | Baali, Mohamed, Auteur ; Ahmed Kassah-Laouarah, Directeur de thèse |
Type de document : | texte imprimé |
Editeur : | Alger : École Nationale Supérieure Vétérinaire, 2021 |
Format : | 187 f. / ill. / 30 cm |
Accompagnement : | CD- Rom |
Note générale : |
Thèse de Doctorat: Sciences Vétérinaire: Alger, École Nationale Supérieure Vétérinaire: 2021
Bibliogr. 37 f.; Annexes 13 f. |
Langues: | Français |
Mots-clés: | Campylobacter thermotolérants ; Poulets ; Hommes ; Résistance aux antibiotiques |
Résumé : |
La présente étude a porté sur 1200 échantillons, dont 960 échantillons aviaires et 240 échantillons humains.
Cette étude a pour objectifs ;l’évaluation de la prévalence des Campylobacterthermotolérants chez le poulet de chair et chez l’homme dans l’Est de l’Algérie, la caractérisation phénotypiquedes souches isolées au moyen de galeries Api Campy et de test d’agglutination au latex (DryspotCampylobacter), l’étude de leursensibilité aux antibiotiques, et en fin l’étude de l’effet de certains facteurs de risque sur le taux de contamination aussi bien chez l’homme que chez la volaille. Pour les échantillons aviaires, selon la norme NF-ISO 10272/2006, l’étude a porté sur 480 échantillons fécaux, 240 cæca et 240 échantillons de peaux de cou. Alors que, pour les échantillons humains, l’étude a porté sur 120 écouvillons rectaux et 120 prélèvements de selles diarrhéiques. Les Campylobacterthermotolérants ont été isolés à partir de 65%, 55% et 70% du total des échantillons fécaux, de peaux de cou et de cæca respectivement. Au niveau des élevages, il existe une recrudescence saisonnière des infections à Campylobacter durant la période estivale (p L’étude du profil de résistance nous a permis d’etablir16 profils de résistance différents. Le plus commun a été constaté 127 fois, incluant cinqueantibiotiques. De plus, elle a révélé que 99.7% des souches présentaient une multirésistance aux antibiotiques. 37,6% des souches isolées présentaient des profils critiques associant une résistance à la ciprofloxacine et à l’érythromycine à la fois. La présence de Campylobacterthermotolérants a été mise en évidence dans 36 échantillons humains, soit un taux d’isolement de 15%, les patients âgés moins 5 ans sont plus exposés à l’infection. La campylobactériose humaine présente une recrudescence saisonnière avec un pic durant la saison chaude estivo- automnale. En revanche, L’infection n'était pas influencée par le sexe du patient.Des résistances acquises aux antibiotiques se sont développées, sauf à la gentamicine et le chloramphénicol. Si la résistance à l’érythromycine est restée faible (5.5%), il est important de surveiller la résistance à la ciprofloxacine qui est en augmentation (41.7%).Les souches humaines isolées appartenaient à trois espèces, l’espèce la plus fréquente C. jejuni (75%) suivie par C. coli (16.7 %) et C. upsaliensis (8.3%). La technique de prélèvement n’a pas une grande influence sur le taux d’isolement chez les volailles. Alors que chez les êtres humains, il semble que l’écouvillonnage rectal donne un taux d’isolement plus élevé que celui obtenu à partir des selles diarrhéiques. D’autre part, nous avons trouvé que le milieu de Karmali (à base de charbon) et Preston (à base de sang) présentaient des taux de récupération et de sélectivité similaires. Abstract : The present study involved 1200 samples, including 960 avian samples and 240 human samples. The objectives of this study are to evaluate the prevalence of thermotolerant Campylobacter in broilers and humans in eastern Algeria, the phenotypic characterization of the isolated strains by means of Api Campy galleries and latex agglutination test (Dryspot Campylobacter), the study of their susceptibility to antibiotics, and finally the study of the effect of some risk factors on the rate of contamination in humans as well as in poultry For the avian samples, according to the NF-ISO 10272/2006 standard, the study involved 480 fecal samples, 240 caeca and 240 neck skin samples. For human samples, 120 rectal swabs and 120 diarrheal stool samples were used. Thermotolerant Campylobacters were isolated from 65%, 55% and 70% of the total faecal, neck skin and caeca samples respectively. At farm level, there was a seasonal increase in Campylobacter infections during the summer period (p The isolated strains belonged to four species, the most frequent species being C. jejuni (73.5%) followed by C. coli (24%), C. lari (1.6%) and C. upsaliensis (0.8%). Antibiotic susceptibility study showed that all strains were resistant to ampicillin and amoxicillin/ac. Clavulanic, (83.3%) to erythromycin, (66.3%) to tetracycline, (46.7%) to ciprofloxacin. On the other hand, no resistance was found for gentamicin. The study of the resistance pattern allowed us to establish 16 different resistance patterns. The most common was found 127 times, including five antibiotics. Furthermore, it revealed that 99.7% of the strains were multidrug-resistant to antibiotics. 37.6% of the isolated strains showed critical profiles combining resistance to both erythromycin and ciprofloxacin. Thermotolerant Campylobacter was detected in 36 human samples, representing a 15% isolation rate. Patients under 5 years of age are at greater risk of infection. Human campylobacteriosis shows a seasonal recrudescence with a peak during the warm summer and fall season. However, the infection was not influenced by the sex of the patient. Acquired resistance to antibiotics has developed, except to gentamicin and chloramphenicol. While resistance to erythromycin remained low (5.5%), it is important to monitor resistance to ciprofloxacin, which is increasing (41.7%). The human strains isolated belonged to three species, the most frequent species C. jejuni (75%) followed by C. coli (16.7%) and C. upsaliensis (8.3%). The sampling technique does not have a great influence on the isolation rate in poultry. Whereas in humans, it seems that rectal swabbing gives a higher isolation rate than that obtained from diarrheal stools. On the other hand, we found that Karmali (charcoal-based) and Preston (blood-based) media had similar recovery rates and selectivity |
Exemplaires (3)
Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
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D4.24024.00/1 | D4.24024.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
D4.24024.00/2 | D4.24024.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
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