| Titre : | Etude sur l’étiologie bactérienne des mammites cliniqueset subcliniques de la vache laitière dans la wilaya de Bordj Bou Arreridj |
| Auteurs : | Sedrati, Tahar, Auteur ; Menoueri, Mohamed Nabil, Directeur de thèse |
| Type de document : | texte imprimé |
| Editeur : | Alger : École Nationale Supérieure Vétérinaire, 2021 |
| Format : | 85 f. / ill. / 30 cm. |
| Accompagnement : | CD- Rom |
| Note générale : |
Thèse de Doctorat: Sciences Vétérinaire: Alger, École Nationale Supérieure Vétérinaire: 2021
Bibliogr. 9 f. |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | Mammite chez les animaux ; Escherichia coli ; Résistance aux antibiotiques |
| Résumé : |
Les mammites compromettentl’industrie de la production laitière et occupent par ailleurs le premier rang en termes d’impact économique au sein des exploitations bovines laitières. Dans notre étude, 600 vaches laitièresappartenant à 100 élevages situés dans 03 communes de la wilaya de Bordj Bou Arreridjont été examinés,durant une période de 24 mois. L’objectif est d’évaluer la prévalence des mammites cliniques et d’identifier les agents pathogènes responsables de ces infections. Suite aux examens cliniques des vaches laitières, il s’avère que les mammites cliniques sont bien présentes dans ces élevages avec un taux de 29 %. Un total de 180 isolats bactériens a été identifié par le système MALDI TOF MS.Les entérobactéries sont les principaux germes responsables des mammites cliniques dans notre échantillon, avec 45% (81 /180) des cas, loin devant les autres germes.Le groupe des staphylocoques à coagulase positive est en seconde position avec 25% (45/180) des cas. En troisième lieu, les mammites causées par la famille des Streptococcaceae représentent 15% (27/180) des cas. Ensuite, vient les Staphylocoques à coagulase négative, Pseudomonas aeroginosa et Acinetobacter pittii avec respectivement 10% (18/180),1,7% (3/180 souches) et 1,1% (1/180) des cas.Ainsi, E. coli est l’espèce la plus fréquemment isolée (52 souches), et représente l’agent dominant dans les isolats de cette étude. Un intérêt particulier a été porté à la caractérisation phénotypique et moléculaire du support génétique de résistances aux antibiotiques, des souches d’E.coli isolées à partir des cas de mammites cliniques. Les tests de sensibilité aux antibiotiques ont été réalisés par la méthode de diffusion sur disque. La réaction de PCR et le séquençage ont été utilisés pour la détection des gènes codant pour : les bêta-lactamases à spectre étendu (blaTEM, blaSHV et blaCTX-M), aux tétracyclines (tetA, tetB, tetC et tetJ), aux aminosides [aph(3’), aac(3’), aac(6’), ant, aad et armA], et aux quinolones (qnrA et qnrB).La technique de conjugaison a été utilisée pour tester la transférabilité des déterminants génétiques de la résistance. Enfin, l’étude de la relation clonale entre les souches multirésistantes a été déterminée par la technique Multi-locus Sequence Typing (MLST). Nos résultats mettaient en avant un haut niveau de résistance des isolats à l’action des tétracyclines (75 %), et des β-lactamines (61,5%).Différents gènes de résistance aux β-lactamines (blaTEM-1), aux tetracyclines (tetA, tetB, tetC et tetJ), aux aminosides (aadA1 et aac(3)-Id), ainsi qu’aux quinolones (qnrA etqnrB), ont été détectés.La conjugaison a montré que les gènesblaTEM, tetA, tetB, qnrB et aadA1 etarmAont été portés sur un plasmide transférable.De plus, Le typage moléculairepar la technique MLST a révéléla présence de trois types de séquences différents (ST162, ST371 et ST 949).
Abstract: Bovine mastitis is among the most costly and commondisease in dairy cows worldwide.In our study, 400 dairy cows were examined, during a period of 24 months, belonging to 100 farms located in 03 communes of the region of Bordj Bou Arreridj. The objective of this study was to investigate the prevalence of clinical mastitis and to identify the pathogens responsible for these infections. Then, a particular interest was brought to the phenotypic and molecular characterization of the genetic support of resistance to antibiotics of E. coli strains isolated from clinical mastitis cases. A total of 180 bacterial isolates were identified by mass spectrometry (MALDI-TOF-MS). The antimicrobialsusceptibility testing was performed by disk diffusion method. Antibiotic resistance genes, including those conferring resistanceto extended-spectrum β-lactamases (i.e., blaTEM, blaSHV, and blaCTX-M), tetracyclines (tetA, tetB, tetC, and tetJ),aminoglycosides [aph (3’), aac (3’), aac (6’), ant, aadA, and armA], and quinolones (qnrA and qnrB) were amplified by standardPCR and sequenced when positive. Transferability of resistance genes has been investigated by conjugation experiments. Following clinical examinations of dairy cows, it turns out that clinical mastitis is indeed present in these herds with a rate of 29%. Enterobacteriaceae are the main germs responsible for clinical mastitis in our sample, with 45% (81/180) of cases, far ahead of other germs. The group of coagulase positive staphylococci is in second position with 25% (45/180) of cases. In the third position, mastitis caused by the Streptococcaceae family represents 15% (27/180) of cases. Then comes the coagulase negative Staphylococci, Pseudomonas aeroginosa and Acinetobacter pittii with respectively 10% (18/180), 1.7% (3/180) and 1.1% (1/180) of cases. Thus, E. coli is the most frequently isolated species (52 strains), and represents the dominant agent in the isolates in this study. The most frequently observed resistance was to amoxicillin (86.5%), followed by tetracycline(75%), amoxicillin–clavulanic acid (59.6%), trimethoprim-sulfamethoxazole (36.5%), doxycycline (13.5%), and ciprofloxacin(13.5%). Multidrug resistance was observed in 38.4% of isolates. Genotypic characterization showed that tetA (44.2%) andblaTEM-1 (30.7%) genes were the most prevalent. Screening for plasmid-mediated quinolone resistance genes demonstrated thatseven isolates (13.5%) expressed qnrB and one isolate (1.9%) harbored qnrA. In addition, aminoglycoside resistancedeterminants including aadA1 and aac(3)-Id were detected in seven and two isolates, respectively. Moreover, blaTEM, tetA, tetB,qnrB, and aadA1were successfully transferred horizontally to transconjugant strains. The multilocus sequence typing revealedthe presence of three different sequence types (ST162, ST371, and ST 949). |
Exemplaires (3)
| Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
|---|---|---|---|---|---|
| D4.05016.00/1 | D4.05016.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
| D4.05016.00/2 | D4.05016.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
| D4.05016.00/3 | D4.05016.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
