| Titre : | Salmonella dans les carcasses de poulets et de dindes de chair exploration des facteurs de risque potentiels de contamination et caractérisation des souches isolées dans les établissements d’abattage de la wilaya d’Alger |
| Auteurs : | Lynda Mezali, Auteur ; Mossadak Hamdi Taha, Directeur de thèse |
| Type de document : | texte imprimé |
| Editeur : | Alger : École Nationale Supérieure Vétérinaire, 2021 |
| Format : | 168 f. / ill. / 30 cm. |
| Accompagnement : | CD- Rom |
| Note générale : |
Thèse de Doctorat: Sciences Vétérinaire: Alger, École Nationale Supérieure Vétérinaire: 2021
Bibliogr. 22 f. ; Annexes 29 f. |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | Salmonelles ; Volailles ; Facteurs de risque ; Surfaces (technologie): Analyse ; Risques pour la santé |
| Résumé : |
Salmonella est l’un des principaux agents pathogènes responsables des maladies d’origine alimentaire. Le présent travail de thèse a été initié dans le but (i) d’estimer la prévalence avec exploration des facteurs de risque associés à la contamination salmonellique des carcasses de volaille, prélevées dans 16 établissements d’abattage de la wilaya d’Alger, (ii) de caractériser les isolats phénotypiquement puis génotypiquement, et (iii) d’examiner le lien de clonalité phénotypique et phylogénétique.
Un total de 1130 échantillons de peaux de cou prélevés de 160 lots de poulets de chair et de 66 lots de dindes de chair, a été examiné. L’isolement et le sérotypage ont été réalisés selon les modalités définies par la norme internationale ISO 6579 (2002), et la recherche des facteurs de risque de contamination par construction d’un modèle de régression logistique pour chaque espèce animale. La sensibilité aux antibiotiques a été étudiée en déterminant la concentration minimale inhibitrice (CMI) par microdilution, avec le système SensititreTM. La caractérisation génotypique a fait appel à la méthode de typage par PFGE avec digestion du génome à l’endonucléase XbaI, suivant la procédure standardisée par le CDC (2015). La prévalence de la contamination salmonellique des échantillons était de 39% chez le poulet et de 17,3% chez la dinde ; le risque de contamination augmenterait lorsque moins de 6 poulets sont échaudés en même temps (OR = 0,31 ; IC 95% : [0,15 - 0,63]) et les carcasses de dindes présenteraient une plus forte probabilité de contamination (OR = 4,44 ; IC 95% : [1,29 - 15,29]) lorsqu’elles sont produites dans les établissements d’abattage de dindes uniquement. Prédominés par Kentucky, Enteritidis et Typhimurium, 11 sérotypes ont été identifiés avec une diversité moyenne. Les taux de résistance et de multirésistance étaient de 98,3% et de 80%, respectivement, avec identification de 33 antibiotypes dont 30 phénotypes de résistance d’alerte. Les souches analysées ont été caractérisées en 47 pulsotypes et 9 pulsogroupes. Globalement, les souches testées étaient fortement liées phénotypiquement alors que leur origine phylogénétique était multiclonale. Les résultats obtenus montrent que tous les établissements enquêtés n’ont pas maîtrisé l’hygiène du procédé d’abattage en livrant un produit fini contaminé par Salmonella. Ils suggèrent la circulation de sérotypes moyennement homogènes mais des antibiotypes et des pulsotypes hétérogènes, ainsi que la commercialisation de certains lots de carcasses non conformes et d’autres à risque élevé de transmission de l’antibiorésistance à l’homme Abstract: Salmonella is one of the major pathogens causing foodborne diseases. The current thesis aims (i) to estimate the prevalence in poultry carcasses sampled in 16 Algiers’ slaughterhouses and explore the potential risk factors related to Salmonella contamination at the batch level, (ii) to characterize the isolates phenotypically and genotypically, and (iii) to analyze the phenotypic and phylogenetic clonal relatedness between these isolates. A total of 1130 neck skin samples taken from 160 broiler batches and 66 turkey batches were examined. The isolation and serotyping were carried out according to the ISO 6579 (2002) international standard, while the risk factors of contamination were explored by building one logistic regression model for each poultry species. Antimicrobial sensitivity was tested by the microdilution method to determine the minimum inhibitory concentration (MIC), using the SensititreTM system. Salmonella isolates were genotyped by PFGE after digestion with XbaI endonuclease following the CDC (2015) procedure. The prevalence of Salmonella contamination in poultry samples was 39% for chickens and 17.3% for turkeys. The probability of contamination would increase when less than 6 chickens are scalded at the same time (OR = 0.31; 95% CI: [0.15 - 0.63]); this probability would be higher (OR = 4.44; 95% CI: [1.29 - 15.29]) when the turkey carcasses are produced in only turkey slaughterhouses. Eleven serotypes were identified with moderate diversity. Kentucky, Enteritidis and Typhimurium were the most prevalent. Resistance and multidrug resistance rates were 98.3% and 80%, respectively ; 33 antibiotypes were identified including 30 worrying antimicrobial profiles. The PFGE typing showed that Salmonella strains belonged to 47 different pulsotypes and 9 different pulsogroups. Overall, the tested strains were strongly phenotypically related whereas their phylogenetic origin was multiclonal. The obtained results show that all slaughterhouses haven’t mastered the hygiene of the slaughter process by producing and marketing a Salmonella-contaminated final product. These findings suggest a spread of moderately homogeneous serotypes but heterogeneous antibiotypes and pulsotypes, as well as the commercialization of some non-compliant carcass batches and other batches representing a high risk human health. |
Exemplaires (3)
| Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
|---|---|---|---|---|---|
| D4.17015.00/1 | D4.17015.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
| D4.17015.00/2 | D4.17015.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
| D4.17015.00/3 | D4.17015.00 | Thèses | B. Magasin des Thèses et PFE | Thèses de Doctorat | Consultation sur place Exclu du prêt |
